Realmente como suspeitei, isso muito provavelmente causado por erros no sistema de arquivos. Sempre que me deparo com problemas similares uso uma iso de winPE, com ela vai conseguir dar boot e fazer os reparos no seu sistema e poderá instalar o linux ao lado como quer, vou te deixar o link aqui.
Este link tem mais informações sobre o funcionamento da iso.
Esse foi o primeiro jeito de sanar o problema e o que acho particularmente mais simples, uma vez que usa ferramentas nativas do sistema para resolver… mas existe opção de instalar um pacote ntfs-3g e tentar o reparo direto do live-cd a documentação para isso esta aqui.
De qualquer forma espero que tenha sucesso!