Das Update ist nicht vollständig durchgelaufen. Der Kernel wurde zu beginn des Update gelöscht, und am Ende nicht wieder hergestellt, weil das Ende nicht abgearbeitet wurde. Sowas sieht man normalerweise in der Konsole, wenn das Update durchläuft als Fehlermeldung. Wenn dann sofort gehandelt wird (ohne reboot) ist das sehr einfach (Update nochmal laufen lassen).
In deinem Fall (nach einem Reboot) muss man das “von aussen” mit einem manjaro vom USB-Stick machen. Dazu wird dann chroot verwendet, und das Update innerhalb chroot neu gestartet.
Ansonsten finden sich eine Menge solche Threads im Forum. Einfach mal 
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