Dies wird immer wieder angezeigt, ich hatte es schon per,
Paketmanager versucht, mit CLI + Flatpak versucht
(Flatpak selbst, hat nichts zu updaten da)
Daher gehe ich stark von einen Bug aus.
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Hallo @Schnuppi 
Hab kurz mal Flatpak über die GUI aktualisiert. Da blieb nichts übrig. Sind das vielleicht Pakete, die EOL sind und es keine Updates mehr dafür gibt? Dann kann da auch nichts aktualisiert werden. Wie heißen die Pakete?
Vielleicht hilft das:
flatpak remove --unused
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ich hab das selbe problem und wusste nichtmal wonach ich suchen sollte! danke…