Bloqueo de aplicaciones, pero interfaz sigue funcionando, ayuda

esto te sucede con cualquier aplicacion?
podrias especificar con que aplicaciones te sucede?

podrias copiar y pegar la salida? de:

inxi -Fxz

como prueba rapida

  • yo crearia un usuario nuevo y ver que tal ahi

(si todo es normal -la configuracion de tu usuario es el problema)

  • probar el live-USB que usaste para instalar manjaro y observar si el problema se repite. debe ser el mismo archivo ISO que descargaste, no uno descargado nuevamente.

(si el problema se repite -es muy probable que tengas un instalador dañado)

segun mi experiencia con aplicaciones congeladas
la solucion mas rapida y sencilla es usar el “AppImage” en su version mas reciente quiza hasta en estado “testing”

yo descartaria problemas con el gestor de ventanas ya que segun nos relatas
puedes cerrar la ventana, minimizarla pero no manipular la aplicacion en si.

tambien
a veces las aplicaciones son lanzadas desde el menu con por ejemplo la orden:

gedit %F
gedit %U

probar a lanzar la aplicacion desde terminal sin opciones extra podria ser la solucion ademas de conseguir un informe de errores si existen.

gedit